Im mikrobiologischen Labor werden Mikroorganismen, die Infektionserreger sind, durch Kulturmethoden, serologische Tests oder direkte Untersuchungen aufgedeckt. Die Mikrobiologielabors unserer Krankenhäuser arbeiten mit modernsten Methoden zur Identifizierung von Bakterien und Antibiogrammen und arbeiten so, dass für alle Arten von Bakterien eine Aerobe- und Anaerobe-Identifizierung durchgeführt werden kann. Fortgeschrittene Antigendiagnosemethoden für Viren werden aktiv und routinemäßig eingesetzt, mit Kultur- und Direktdiagnosemethoden für die Erreger von Pilz- und Parasiteninfektionen.

Zu diesem Zweck wurde EKM eingerichtet, um den Einsatz ungeeigneter Antibiotika zu verhindern, das Krankenhauspersonal kontinuierlich für die Infektionskontrolle zu schulen, die Abfallkontrolle durchzuführen und die Krankenhausreinigung mit den modernsten Methoden durchzuführen, und wird von einem Facharzt für Infektionskrankheit geleitet.